RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484141.5

PCGF3-211, Transcript of polycomb group ring finger 3, humanhuman

TSL 2

Gene PCGF3, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3-211ENST00000484141 HTR2AP28223 471 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ZNF83P51522 516 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 SELPLGQ14242 412 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 GABRA6Q16445 453 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ZNF440Q8IYI8 595 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 KDM8Q8N371 416 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 WDR31Q8NA23 367 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 TRIM2Q9C040 744 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ASB6Q9NWX5 421 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.67□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 RNF212BA8MTL3 300 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 GPR171O14626 319 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ABCD4O14678 606 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 NPIPB7O75200 414 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 CRLF1O75462 422 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 CD8AP01732 235 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 EGR4Q05215 589 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.069e-9■■■■□ 21.4
PCGF3-211ENST00000484141 ADRM1Q16186 407 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 GPAT4Q86UL3 456 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 BBS10Q8TAM1 723 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 FBXW5Q969U6 566 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 MALT1Q9UDY8 824 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.66□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 AQP7P3A6NL99 342 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 A8MVM7 634 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 OVOL3O00110 214 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 GPIP06744 558 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 UQCRBP14927 111 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 AQP1P29972 269 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ATP5J2P56134 94 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 COPZ1P61923 177 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 FADDQ13158 208 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 SQLEQ14534 574 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 LINGO2Q7L985 606 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 HDXQ7Z353 690 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 RETREG3Q86VR2 466 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 MUCL1Q96DR8 90 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 MUS81Q96NY9 551 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 IFT52Q9Y366 437 aa14.65□□□□□ -0.06
PCGF3-211ENST00000484141 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 TMEM247A6NEH6 219 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 C5orf58C9J3I9 102 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 E7EQL1 145 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 M0R1B8 84 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 TPST2O60704 377 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 C8BP07358 591 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 PAX1P15863 534 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 CBLP22681 906 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 SELENOPP49908 381 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 ATP4BP51164 291 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 CDK6Q00534 326 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 AAED1Q7RTV5 226 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 MAGEB18Q96M61 343 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 NPHS2Q9NP85 383 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 NGBQ9NPG2 151 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 UPB1Q9UBR1 384 aa14.64□□□□□ -0.07
PCGF3-211ENST00000484141 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms