RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 A8MVM7 634 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SHISA9B4DS77 424 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF208O43345 1280 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJA2O60884 412 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINI2O75830 405 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV4-39P01824 125 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ITGA5P08648 1049 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TFPTP0C1Z6 253 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 CD40P25942 277 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 NTF4P34130 210 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 CAPZA2P47755 286 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 AQP5P55064 265 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 NCALDP61601 193 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TUBA1BP68363 451 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TUBA4AP68366 448 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TGFBR3Q03167 851 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PLAURQ03405 335 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS3BPQ08380 585 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PDK3Q15120 406 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 RAB35Q15286 201 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 RGNQ15493 299 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 GABRA6Q16445 453 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PGGHGQ32M88 737 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 AGKQ53H12 422 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 NIPAL3Q6P499 406 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 VHLLQ6RSH7 139 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TUBA1AQ71U36 451 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TLCD1Q96CP7 247 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO17Q96EF6 278 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 EBF4Q9BQW3 602 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PRR14Q9BWN1 585 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 REG4Q9BYZ8 158 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 LIPT2A6NK58 231 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 EVPLLA8MZ36 301 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 E7EQL1 145 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 DNPH1O43598 174 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 LGI1O95970 557 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 WNT11O96014 354 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 GUSBP08236 651 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 DANCRP0C864 163 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 COX5AP20674 150 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PTAFRP25105 342 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SELENOPP49908 381 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 IDH3AP50213 366 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN17P56750 224 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PRPS1P60891 318 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 DMTNQ08495 405 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SLC17A1Q14916 467 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK11Q15759 364 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 CARD17Q5XLA6 110 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 EPGNQ6UW88 154 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 KRT73Q86Y46 540 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 MUC15Q8N387 334 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 BBS10Q8TAM1 723 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SPDL1Q96EA4 605 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 MDFIQ99750 246 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM19Q9H013 955 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 FKRPQ9H9S5 495 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-209ENST00000480420 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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