RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ABCA4P78363 2273 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WUJ7 227 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ELOVL7A1L3X0 281 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 AQP7P3A6NL99 342 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 NME4O00746 187 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 AHSA1O95433 338 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 NUDT2P50583 147 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A2P52569 658 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CDH12P55289 794 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 LIPEQ05469 1076 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 MICU2Q8IYU8 434 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 MED18Q9BUE0 208 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FAM53CQ9NYF3 392 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 GPR52Q9Y2T5 361 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CASKO14936 926 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FZD7O75084 574 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 GOSR1O95249 250 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ADAP00813 363 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 HRGP04196 525 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 THY1P04216 161 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 KDELR2P33947 212 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 RPS5P46782 204 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ENTPD8Q5MY95 495 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ZNF613Q6PF04 617 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZT83 130 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 P3H2Q8IVL5 708 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ZNF100Q8IYN0 542 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 TAAR8Q969N4 342 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 OR10A4Q9H209 315 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SELENONQ9NZV5 590 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CREBBPQ92793 2442 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SIAH2O43255 324 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 LYPD3O95274 346 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 THBDP07204 575 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PPP3CBP16298 524 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PSME3P61289 254 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SFRP5Q5T4F7 317 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 C5orf46Q6UWT4 87 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 LINC00114Q6XXX2 140 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CDC20BQ86Y33 519 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ZIC4Q8N9L1 334 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 OR9K2Q8NGE7 335 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 RNF217Q8TC41 542 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A36Q96CQ1 311 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 HDHD5Q9BXW7 423 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ACTR6Q9GZN1 396 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 BAG5Q9UL15 447 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 OR2T1O43869 369 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 IFNA14P01570 189 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF1BP20333 461 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CRYGSP22914 178 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ITGADQ13349 1161 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 P2RY6Q15077 328 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 TSC22D1Q15714 1073 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CYBRD1Q53TN4 286 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FAM69AQ5T7M9 428 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 TMEM225Q6GV28 225 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CARM1Q86X55 608 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ANKS4BQ8N8V4 417 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 NRGNQ92686 78 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PROX1Q92786 737 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 APH1AQ96BI3 265 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ZNF226Q9NYT6 803 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ABCD2Q9UBJ2 740 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PDZD2O15018 2839 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 DEFB108AA8MXU0 73 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 VAMP5O95183 116 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-9P01782 118 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 GSK3BP49841 420 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 LTBQ06643 244 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 POU4F3Q15319 338 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FBXW9Q5XUX1 488 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 OR6S1Q8NH40 331 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 TMEM45BQ96B21 275 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 S100PBPQ96BU1 408 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 LRRC37BQ96QE4 947 aa18.52■□□□□ 0.56
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