RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SERPINA11Q86U17 422 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 KRT73Q86Y46 540 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CADM2Q8N3J6 435 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SLC35B4Q969S0 331 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 Q96MF0 132 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PIP5K1AQ99755 562 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FANCFQ9NPI8 374 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ARMCX1Q9P291 453 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CR1P17927 2039 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TRIM64A6NGJ6 449 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TRIM64BA6NI03 449 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HS3ST1O14792 307 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 AKR7A3O95154 331 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 UQCRBP14927 111 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PTNP21246 168 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SLC6A2P23975 617 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 MNAT1P51948 309 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 BSPH1Q075Z2 132 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CEACAM7Q14002 265 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CYP51A1Q16850 503 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SHEQ5VZ18 495 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 REEP3Q6NUK4 255 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ERICH5Q6P6B1 374 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 COMTD1Q86VU5 262 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TMEM99Q8N816 258 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HIPK4Q8NE63 616 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 OR52E4Q8NGH9 312 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HSD17B8Q92506 261 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 C18orf12Q96KH6 178 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF607Q96SK3 696 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ECSITQ9BQ95 431 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PRR14Q9BWN1 585 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NDE1Q9NXR1 346 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 H7C1Q1 480 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FAAHO00519 579 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF208O43345 1280 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SERPINB7O75635 380 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 RAD51DO75771 328 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SOD3P08294 240 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 INHBBP09529 407 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FOSL1P15407 271 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 COX5AP20674 150 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HTR3AP46098 478 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PTH2RP49190 550 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NR1H2P55055 460 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CDK6Q00534 326 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FAPQ12884 760 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SCARB2Q14108 478 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PDK3Q15120 406 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 RNF220Q5VTB9 566 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF611Q8N823 705 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 DDIT4LQ96D03 193 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 RCN3Q96D15 328 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 POM121Q96HA1 1249 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NANOGQ9H9S0 305 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.47□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LIPT2A6NK58 231 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FXYD1O00168 92 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF9O43307 516 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TPST1O60507 370 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PGM3O95394 542 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms