RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.45□□□□□ -0.42
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SH3BP1-206ENST00000469947 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM138Q9NPI0 162 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
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SH3BP1-206ENST00000469947 LAMP2P13473 410 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 DLX5P56178 289 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 NTHL1P78549 312 aa12.43□□□□□ -0.42
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SH3BP1-206ENST00000469947 LGALS3BPQ08380 585 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PCGF3Q3KNV8 242 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 TCEAL5Q5H9L2 206 aa12.43□□□□□ -0.42
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