RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ERVK-25P63136 954 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 DGCR2P98153 550 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 FZD2Q14332 565 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 RASD2Q96D21 266 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 COPZ2Q9P299 210 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 OR6C68A6NDL8 312 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ARPC3O15145 178 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 FOXS1O43638 330 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 OR7A10O76100 309 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ALX3O95076 343 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 TCRBP04435 133 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 MAOAP21397 527 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 PSMB10P40306 273 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 CEP78Q5JTW2 689 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 PARGQ86W56 976 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 SIAH3Q8IW03 269 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 C3orf49Q96BT1 292 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 CD207Q9UJ71 328 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 COPS3Q9UNS2 423 aa16.78■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 GPRIN2O60269 458 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 CD1AP06126 327 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 HPGDP15428 266 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF24P17028 368 aa16.77■□□□□ 0.28
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SYNE4-204ENST00000465425 GRK6P43250 576 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 BLKP51451 505 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 GALK2Q01415 458 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 FCN2Q15485 313 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ELOA3Q8NG57 546 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ZNRF4Q8WWF5 429 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 HSD17B8Q92506 261 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 MFRPQ9BY79 579 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.77■□□□□ 0.28
SYNE4-204ENST00000465425 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 HTR2BP41595 481 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 HSF2Q03933 536 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GATSQ8NAP1 163 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 LGALS14Q8TCE9 139 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PHYHIPQ92561 330 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SCMH1Q96GD3 660 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CACNG6Q9BXT2 260 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF222Q9UK12 451 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ING4Q9UNL4 249 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CAMK2AQ9UQM7 478 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GVT2 93 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 C7orf66A4D0T2 115 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 IMPA2O14732 288 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 FABP7O15540 132 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 AKR7A2O43488 359 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SRMP19623 302 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GRPRP30550 384 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CCR4P51679 360 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ANGPT1Q15389 498 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2NLQ5JXB2 153 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 LEG1Q6P5S2 330 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 JAZF1Q86VZ6 243 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 NOX4Q9NPH5 578 aa16.76■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PSMD9O00233 223 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF749O43361 778 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PRKCAP17252 672 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GNG2P59768 71 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 FUT7Q11130 342 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ISXQ2M1V0 245 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 TCTN2Q96GX1 697 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 MAP3K3Q99759 626 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GHITMQ9H3K2 345 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PRODH2Q9UF12 536 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PDCD5O14737 125 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GLCEO94923 617 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CCR5P51681 352 aa16.75■□□□□ 0.27
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