RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52J3Q8NH60 311 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OSTF1Q92882 214 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 DDIT4LQ96D03 193 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ADGRG7Q96K78 797 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL5BQ96KC2 179 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PIP5K1AQ99755 562 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CHID1Q9BWS9 393 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf10Q9HB07 376 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TINAGQ9UJW2 476 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CLCA1A8K7I4 914 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 AHRRA9YTQ3 701 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PRRG2O14669 202 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAMDEC1O15204 470 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PIP5K1CO60331 668 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TIPRLO75663 272 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 F13BP05160 661 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 IMPDH2P12268 514 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 KLK2P20151 261 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB6AP20340 208 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CBLP22681 906 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC7A1P30825 629 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RRM2P31350 389 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEA2P43356 314 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT2B15P54855 530 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CARD18P57730 90 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2B6P58173 313 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTR3P61158 418 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 LTBQ06643 244 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 MYBPHQ13203 477 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAM2Q15035 370 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OR7A5Q15622 319 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SGCBQ16585 318 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF605Q86T29 641 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T29Q8NH02 315 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10D3Q8NH80 312 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PFN4Q8NHR9 129 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 STK35Q8TDR2 534 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TAAR8Q969N4 342 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 MPP4Q96JB8 637 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIB1Q96RU8 372 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF347Q96SE7 839 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 VNN3Q9NY84 501 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A087WUU8 490 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRN3E7EW58 273 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 SULT2B1O00204 365 aa7.53□□□□□ -1.2
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFRSF11BO00300 401 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms