RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 SDHBP21912 280 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 DIO1P49895 249 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CCR4P51679 360 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.071e-9■□□□□ 9
ACTB-207ENST00000462494 CEP78Q5JTW2 689 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SIAH3Q8IW03 269 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 MAP3K3Q99759 626 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GON7Q9BXV9 100 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HSPB11Q9Y547 144 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 C4orf47A7E2U8 309 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 EFCAB7A8K855 629 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 TNK1Q13470 666 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 FCN2Q15485 313 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PRSS45Q7RTY3 260 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 GPR174Q9BXC1 333 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PPM1BO75688 479 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 OR7A10O76100 309 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 UCHL1P09936 223 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GIFP27352 417 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 GALK2Q01415 458 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 KIAA0895LQ68EN5 471 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 LEG1Q6P5S2 330 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 C3orf49Q96BT1 292 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 NOX4Q9NPH5 578 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 VCANP13611 3396 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GUSBP08236 651 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MAGEB1P43366 347 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MMP15P51511 669 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CCR6P51684 374 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SKP1P63208 163 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 DERL3Q96Q80 235 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.072e-23■■■□□ 15.6
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF222Q9UK12 451 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ACOD1A6NK06 481 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 TCRBP04435 133 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HPGDP15428 266 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HTR2BP41595 481 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ELOA3BQ3SY89 546 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HES5Q5TA89 166 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CMIPQ8IY22 773 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ELOA3Q8NG57 546 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 FABP7O15540 132 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MT-ND4P03905 459 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF24P17028 368 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SRMP19623 302 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 AQP2P41181 271 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GRK6P43250 576 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HACD4Q5VWC8 232 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 BMPERQ8N8U9 685 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 Q96M85 177 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 TSSK2Q96PF2 358 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 LRRC61Q9BV99 259 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CACNG6Q9BXT2 260 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SPATA2Q9UM82 520 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 TRIOO75962 3097 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF879B4DU55 563 aa15.48■□□□□ 0.07
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