RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 ETFAP13804 333 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MPGP29372 298 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CRATP43155 626 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP2K6P52564 334 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MVDP53602 400 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 DSCR9P59020 149 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PRPS1P60891 318 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 COPZ1P61923 177 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LGALS3BPQ08380 585 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 GSTA3Q16772 222 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LIN52Q52LA3 116 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF544Q6NX49 715 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 GPAT4Q86UL3 456 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF525Q8N782 197 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM45BQ96B21 275 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 FKRPQ9H9S5 495 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 THAP1Q9NVV9 213 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CUBNO60494 3623 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM120BA0PK00 339 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 AQP7P3A6NL99 342 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC22A3O75751 556 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT33AO76009 404 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LY6HO94772 140 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ANP32DO95626 131 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 IL6P05231 212 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 BCHEP06276 602 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TFPTP0C1Z6 253 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 IDO1P14902 403 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 DSTNP60981 165 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CHRNB3Q05901 458 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 GTDC1Q4AE62 458 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO17Q96EF6 278 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MOKQ9UQ07 419 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF212BA8MTL3 300 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MVM7 634 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 H7C417 338 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 FRS3O43559 492 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LGI1O95970 557 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 WNT11O96014 354 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNA2P01563 188 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 BMP4P12644 408 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A16P16260 332 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SELENOPP49908 381 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 P2RY4P51582 365 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 EFNA4P52798 201 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CRISP3P54108 245 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXC5Q00444 222 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ELOA3BQ3SY89 546 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 C6orf10Q5SRN2 563 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF220Q5VTB9 566 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf140Q5VVS0 124 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM225Q6GV28 225 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MAVSQ7Z434 540 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CROCCP2Q86T23 111 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SERPINA11Q86U17 422 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ELOA3Q8NG57 546 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM168AQ92567 244 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms