RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR70Q9NW82 654 aa17.08■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIF3AQ9Y2N7 669 aa17.08■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa17.08■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SC5DO75845 299 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPI1P17947 270 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL12BP29460 328 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACVR1BP36896 505 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIO1P49895 249 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTA2P62736 377 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTG2P63267 376 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF117Q03924 483 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MADCAM1Q13477 382 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TP53I3Q53FA7 332 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35F2Q8IXU6 374 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf53Q8N6V4 93 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD4Q8TB40 342 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOSTQ9BQB4 213 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAT2Q9GZY6 243 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NANSQ9NR45 359 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MKL2Q9ULH7 1088 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.07■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC14L5O43304 696 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHC1P29353 583 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCN1P31025 176 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AQP2P41181 271 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASAH1Q13510 395 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35D3Q5M8T2 416 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM27D1Q5T7N8 215 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYS1Q8N2H4 156 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF563Q8TA94 476 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEDD4LQ96PU5 975 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WWTR1Q9GZV5 400 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPS7AQ9UBW8 275 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TACR3P29371 465 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EVX1P49640 407 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRG3P56975 720 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HBMQ6B0K9 141 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEACAM19Q7Z692 300 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PXKQ7Z7A4 578 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1N1Q8NGS0 311 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTSFQ9UBX1 484 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa17.06■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TO15178 435 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPAN2O60636 221 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASAH2BP0C7U1 165 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APEX1P27695 318 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A8P48029 635 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLCXD2Q0VAA5 305 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNJ8Q15842 424 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDONQ4KMG0 1287 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM122BQ7Z309 247 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC75AQ8NAA5 344 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6K6Q8NGW6 343 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GHSRQ92847 366 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PELI1Q96FA3 418 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q96M85 177 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAM19Q9H013 955 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MALT1Q9UDY8 824 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VCANP13611 3396 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCRTR2O43614 444 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SELENOFO60613 162 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINI2O75830 405 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD14P08571 375 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UQCRC1P31930 480 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LTBQ06643 244 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL10RAQ13651 578 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALG10Q5BKT4 473 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IDNKQ5T6J7 187 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LEG1Q6P5S2 330 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LANCL3Q6ZV70 420 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC29A4Q7RTT9 530 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A15Q8N5U1 240 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF31Q96EP0 1072 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C12orf10Q9HB07 376 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPAP1Q9NZP6 1156 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIT1Q9Y3P8 196 aa17.05■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OGG1O15527 345 aa17.04■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APEHP13798 732 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYL9P24844 172 aa17.04■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 26.1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAB2P98082 770 aa17.04■□□□□ 0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P2RY14Q15391 338 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms