RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 RP2O75695 350 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GATBO75879 557 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT33AO76009 404 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RCBTB2O95199 551 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 LYPD3O95274 346 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R3DO95685 299 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFS1P28331 727 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPZA2P47755 286 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GDI2P50395 445 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 AP3S2P59780 193 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ID2Q02363 134 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TMUB2Q71RG4 321 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SHISA5Q8N114 240 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2L13Q8N349 312 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD9Q8NBP5 474 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 KXD1Q9BQD3 176 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF626Q68DY1 528 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4C6Q8NH72 309 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GRHL3Q8TE85 626 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 THEM6Q8WUY1 208 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB7BQ96AH8 199 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GDE1Q9NZC3 331 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 KLK11Q9UBX7 282 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 AIPO00170 330 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 WDPCPO95876 746 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HIST1H2ABP04908 130 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 FCER2P06734 321 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMP2P13473 410 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GJA4P35212 333 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTC1P68032 377 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTA1P68133 377 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00303Q3SY05 128 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM19Q96E16 107 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 OR14A2Q96R54 314 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 DMRTA2Q96SC8 542 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NRIP3Q9NQ35 241 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NTMQ9P121 344 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL2Q9UKC9 423 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 AGR2O95994 175 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 WASP42768 502 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 FGL2Q14314 439 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK5R1Q15078 307 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HES5Q5TA89 166 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 AGBL4Q5VU57 503 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK20Q8IZL9 346 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ORAI1Q96D31 301 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A38Q96DW6 304 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 MYADMQ96S97 322 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 IL5P05113 134 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 THBS1P07996 1170 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NID1P14543 1247 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRA1P14867 456 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF3P17036 446 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RUNX3Q13761 415 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 RPE65Q16518 533 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 DCST2Q5T1A1 773 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF425Q6IV72 752 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD10Q9NXR5 420 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms