RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C20orf85Q9H1P6 137 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TUBA4BQ9H853 241 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IL26Q9NPH9 171 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STARD5Q9NSY2 213 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 B3GNT2Q9NY97 397 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 POLEQ07864 2286 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBC2A0A5B9 178 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VEGFDO43915 354 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TPST2O60704 377 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PTP4A3O75365 173 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RP2O75695 350 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UGT2B17O75795 530 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDUFB10O96000 172 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPN1P04843 607 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC35G4P0C7Q5 338 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSH1P0DML2 217 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSH2P0DML3 217 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EZRP15311 586 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CASTP20810 708 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RFC4P35249 363 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAGEA5P43359 124 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IL1RL1Q01638 556 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TGM3Q08188 693 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHAF1BQ13112 559 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VGLL4Q14135 290 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDIA5Q14554 519 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIAA0087Q14695 138 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHRNA6Q15825 494 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STXBP2Q15833 593 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SGCAQ16586 387 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STX1AQ16623 288 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMU1Q2TAY7 513 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KCTD16Q68DU8 428 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRMT9Q6P2P2 845 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CBLN3Q6UW01 205 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF767PQ75MW2 155 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STEAP2Q8NFT2 490 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR4F17Q8NGA8 305 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR4K5Q8NGD3 323 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FANK1Q8TC84 345 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ABHD3Q8WU67 409 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C15orf40Q8WUR7 153 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GGHQ92820 318 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RIT1Q92963 219 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNAJC19Q96DA6 116 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VMP1Q96GC9 406 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC39A13Q96H72 371 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HPDLQ96IR7 371 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF488Q96MN9 340 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TIGD1Q96MW7 591 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSSK3Q96PN8 268 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR4F4Q96R69 305 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GAL3ST1Q99999 423 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC25A23Q9BV35 468 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KATNB1Q9BVA0 655 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DEFB127Q9H1M4 99 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SIAEQ9HAT2 523 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM114A2Q9NRY5 505 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF492Q9P255 531 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLCF1Q9UBD9 225 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PGAP2Q9UHJ9 254 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATG2BQ96BY7 2078 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRGV2A0A075B6R0 118 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A087X0K7 114 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A6NIZ1 184 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANXA2P2A6NMY6 339 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C12orf71A8MTZ7 269 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LEUTXA8MZ59 168 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 E7ESA3 106 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RASGRF2O14827 1237 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 REC8O95072 547 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LGI1O95970 557 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HLA-DQB1P01920 261 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BCHEP06276 602 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HEXBP07686 556 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VIMP08670 466 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGHV3-43DP0DP04 118 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF30P17039 623 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SOAT1P35610 550 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
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