RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 PAPLNO95428 1278 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 NOVP48745 357 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 FABP5Q01469 135 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR2F1Q13607 317 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 SCD5Q86SK9 330 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 RDH10Q8IZV5 341 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.13□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 IKZF5Q9H5V7 419 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 POMT2Q9UKY4 750 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 UMAD1C9J7I0 102 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 CBX7O95931 251 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 MAP2K6P52564 334 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 ACSM1Q08AH1 577 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR1Q1Q15612 314 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 RNF208Q9H0X6 261 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 NME2P1O60361 137 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 DFFBO76075 338 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 B3GALT4O96024 378 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 GABRR1P24046 479 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 CCINQ13939 588 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 RNF128Q8TEB7 428 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR7D2Q96RA2 312 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 PRR14Q9BWN1 585 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 CWH43Q9H720 699 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 ADH5P11766 374 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 CD53P19397 219 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OPRD1P41143 372 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 Q499Y3 187 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 GAREM1Q9H706 876 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 ZNF587BE7ETH6 402 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 M0R082 166 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 SERPINE2P07093 398 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 GALTP07902 379 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 CD1EP15812 388 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 IL1RNP18510 177 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF681Q96N22 645 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 PIGQQ9BRB3 760 aa9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-202ENST00000402738 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 ACER3Q9NUN7 267 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 A0A0B4J203 849 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-202ENST00000402738 MTHFD2P13995 350 aa9.11□□□□□ -0.95
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