RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389720.3

SPTB-202, Transcript of spectrin beta, erythrocytic, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPTB, Length 6,321 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTB-202ENST00000389720 ITGAMP11215 1152 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 LBX1P52954 281 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CLDN2P57739 230 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SRPXP78539 464 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 FZD9O00144 591 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 MTCP1P56278 107 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SH3BP2P78314 561 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 BPIFB2Q8N4F0 458 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 TNFRSF10AO00220 468 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SCRG1O75711 98 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 PPT1P50897 306 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 LIPHQ8WWY8 451 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CPNE5Q9HCH3 593 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SOCS6O14544 535 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ITGB8P26012 769 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 FABP6P51161 128 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RAB33AQ14088 237 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 VRK2Q86Y07 508 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 PIGQQ9BRB3 760 aa11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 G0S2P27469 103 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CDK5R2Q13319 367 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 AAED1Q7RTV5 226 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SVBPQ8N300 66 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 TIMD4Q96H15 378 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ADOQ96SZ5 270 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 C4orf47A7E2U8 309 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SPINT2O43291 252 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 MBP02144 154 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 MMP12P39900 470 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 NFATC3Q12968 1075 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 TFAP2CQ92754 450 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SHARPINQ9H0F6 387 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 AQP7O14520 342 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 NXPH2O95156 264 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SELEP16581 610 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SSTR4P31391 388 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CSN1S1P47710 185 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 35.6
SPTB-202ENST00000389720 SLC35A2P78381 396 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RAB35Q15286 201 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 MEP1BQ16820 701 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 DESI1Q6ICB0 168 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 APOOLQ6UXV4 268 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CORO2AQ92828 525 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 NXPH3O95157 252 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 FECHP22830 423 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SORDQ00796 357 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SLC14A2Q15849 920 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.555e-6■■■□□ 15.3
SPTB-202ENST00000389720 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CLSTN3Q9BQT9 956 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 C1orf198Q9H425 327 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 CREBZFQ9NS37 354 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 PHLPP1O60346 1717 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 KRBA1A5PL33 1030 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RAB38P57729 211 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RTP2Q5QGT7 225 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 DLK2Q6UY11 383 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ADGRG5Q8IZF4 528 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 NIPAL2Q9H841 368 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa11.63□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 LRIT2A6NDA9 550 aa11.62□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 RAB27BO00194 218 aa11.62□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 PPP3CBP16298 524 aa11.62□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 PGGHGQ32M88 737 aa11.62□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 BEX5Q5H9J7 111 aa11.62□□□□□ -0.55
SPTB-202ENST00000389720 SERPINA11Q86U17 422 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms