RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CSPG4P5Q96PW8 444 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 CPNE1Q99829 537 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 ING2Q9H160 280 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 RASSF1Q9NS23 344 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 RAB20Q9NX57 234 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 CD274Q9NZQ7 290 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 COPZ2Q9P299 210 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 RNF6Q9Y252 685 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 EPM2AB3EWF7 344 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 H7C2Y5 167 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 PLOD3O60568 738 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 CST8O60676 142 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 C22orf31O95567 290 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 IFNA10P01566 189 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 GPR17Q13304 367 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 GPR68Q15743 365 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 NAXDQ8IW45 347 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 SKA3Q8IX90 412 aa3.13□□□□□ -1.91
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