RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 FJX1Q86VR8 437 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MUCL1Q96DR8 90 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SEC22AQ96IW7 307 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 A0A0G2JNG1 304 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ACOD1A6NK06 481 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GPR39O43194 453 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZFAND5O76080 213 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 KIR2DS5Q14953 304 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF74Q16587 644 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CBLL1Q75N03 491 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 NTMT1Q9BV86 223 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MED20Q9H944 212 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 H7C1C5 153 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PPP6CO00743 305 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC43A1O75387 559 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 IL1AP01583 271 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 RAP2BP61225 183 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 LCN6P62502 163 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.97□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PTHP01270 115 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HOXD12P35452 270 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SCD5Q86SK9 330 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 C3orf30Q96M34 536 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CDHR4A6H8M9 788 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC2A1P11166 492 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 NME2P22392 152 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CDKN3Q16667 212 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 DTD2Q96FN9 168 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 E9PI62 339 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 DOK2O60496 412 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CEBPBP17676 345 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CCR7P32248 378 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ10P78508 379 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 DEFA6Q01524 100 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF597Q96LX8 424 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 RNF32Q9H0A6 362 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 A0A0D9SG52 128 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 C20orf202A1L168 122 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PRSS38A1L453 326 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ARNTLO00327 626 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CBR1P16152 277 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TACR3P29371 465 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF92Q03936 586 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GPR176Q14439 515 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OR4A16Q8NH70 328 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MUL1Q969V5 352 aa14.96□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLDN17P56750 224 aa14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PKDCCQ504Y2 493 aa14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 EGLN2Q96KS0 407 aa14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.96□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLDN1O95832 211 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLEC3BP05452 202 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HLA-DOBP13765 273 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PPP3CBP16298 524 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR1D4P47884 311 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF91Q05481 1191 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms