RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 SUSD5O60279 629 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MT-CO3P00414 261 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 LTBQ06643 244 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GPR50Q13585 617 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GGTLC2Q14390 218 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SSPNQ14714 243 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ALG10Q5BKT4 473 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PHC2Q8IXK0 858 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TAAR8Q969N4 342 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MUC3AQ02505 3323 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TTC28Q96AY4 2481 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF208O43345 1280 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 INHBBP09529 407 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SBK2P0C263 348 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PRKCAP17252 672 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 AQP2P41181 271 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SLC25A1P53007 311 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CSRP2Q16527 193 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 KLHL12Q53G59 568 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FAM122BQ7Z309 247 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 AMER2Q8N7J2 671 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 UFD1Q92890 307 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 COQ7Q99807 217 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ASPNQ9BXN1 380 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR51E2Q9H255 320 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PISDQ9UG56 409 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TCFL5Q9UL49 500 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TMEM72A0PK05 275 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SDHAP31040 664 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PTGDSP41222 190 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GALEQ14376 348 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PON3Q15166 354 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SGCBQ16585 318 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GLRX5Q86SX6 157 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ADCK1Q86TW2 530 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ESX1Q8N693 406 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR4K13Q8NH42 304 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FRMD6Q96NE9 622 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MMP27Q9H306 513 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MED20Q9H944 212 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SSR3Q9UNL2 185 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MOKQ9UQ07 419 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MPDZO75970 2070 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ITGA10O75578 1167 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 AHSA1O95433 338 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GAAP10253 952 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TCN2P20062 427 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GALP22466 123 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms