RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 UFD1Q92890 307 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 RELTQ969Z4 430 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 DDOQ99489 341 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TIMP4Q99727 224 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CMKLR1Q99788 373 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SSR3Q9UNL2 185 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TMED7Q9Y3B3 224 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 DAPL1A0PJW8 107 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 F13BP05160 661 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SBK2P0C263 348 aa16.24■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 CTXN1P60606 82 aa16.24■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 MISPQ8IVT2 679 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZNRF4Q8WWF5 429 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SMPDL3BQ92485 455 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 Q96M85 177 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 DACH2Q96NX9 599 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ALG8Q9BVK2 526 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ASPNQ9BXN1 380 aa16.24■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 IDUAP35475 653 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 ALG10Q5BKT4 473 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 KLBQ86Z14 1044 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ELP5Q8TE02 316 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NPAS1Q99742 590 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 HRH3Q9Y5N1 445 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 HIST1H2ABP04908 130 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TM9SF2Q99805 663 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 ASB6Q9NWX5 421 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CLDN25C9JDP6 229 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A12O75746 678 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CD14P08571 375 aa16.22■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 GALEQ14376 348 aa16.22■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 LINC00299Q6ZSB3 139 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 FAM122BQ7Z309 247 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NAXDQ8IW45 347 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 RNF138Q8WVD3 245 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PTDSS2Q9BVG9 487 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 FKRPQ9H9S5 495 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 COX6A1P12074 109 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PTGDSP41222 190 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ACSM1Q08AH1 577 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 C22orf42Q6IC83 251 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 LEG1Q6P5S2 330 aa16.21■□□□□ 0.19
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