RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PRAF2O60831 178 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SPI1P17947 270 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SRMP19623 302 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 EPHA4P54764 986 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 FAM53BQ14153 422 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC28AQ8IWP9 274 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 OR4N2Q8NGD1 307 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 GFI1Q99684 422 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 MRI1Q9BV20 369 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 AUNIPQ9H7T9 357 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 NOX4Q9NPH5 578 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 NAP1L6A6NFF2 107 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 IFITM5A6NNB3 132 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 PEX14O75381 377 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 RDH16O75452 317 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 CRYZL1O95825 349 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 YPEL5P62699 121 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF684Q5T5D7 378 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A38Q96DW6 304 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 DERL3Q96Q80 235 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SLC19A3Q9BZV2 496 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 NANSQ9NR45 359 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 DLL4Q9NR61 685 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SCN2AQ99250 2005 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PQ72 361 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 TSC22D2O75157 780 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 TGM6O95932 706 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 DPP4P27487 766 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 CCR9P51686 369 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF281Q9Y2X9 895 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 GABARAPH6UMI1 98 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SULT1B1O43704 296 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 SELENOFO60613 162 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 OR7A10O76100 309 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 IGF2P01344 180 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 UQCRC1P31930 480 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 PRSS45Q7RTY3 260 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 NMNAT3Q96T66 252 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD1-201ENST00000331462 OR6C68A6NDL8 312 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 ADRB1P08588 477 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 AP3S2P59780 193 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 ZP1P60852 638 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 CAPN10Q9HC96 672 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 C5orf42Q9H799 3197 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 SHOXO15266 292 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 GLCEO94923 617 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 RPL4P36578 427 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 MNDAP41218 407 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 LINC01590Q5TEZ4 76 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 SLC6A19Q695T7 634 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 FAM71CQ8NEG0 241 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 PATE1Q8WXA2 126 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 RIT1Q92963 219 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 HRASLSQ9HDD0 168 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD1-201ENST00000331462 DNASE1P24855 282 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms