RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 V9GY05 133 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 UPK1AO00322 258 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CD14P08571 375 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TNFSF8P32971 234 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 MMP28Q9H239 520 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 MYO10Q9HD67 2058 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR2A25A4D2G3 310 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 H3BUI4 141 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ATAD3CQ5T2N8 411 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR52N1Q8NH53 320 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NEURL2Q9BR09 285 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PRSS3P35030 304 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FNTBP49356 437 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SRYQ05066 204 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CDNFQ49AH0 187 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 KMT5CQ86Y97 462 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 KLF15Q9UIH9 416 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 LMO7DNF2Z398 122 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SSR4P51571 173 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RUNX2Q13950 521 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FAHD1Q6P587 224 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RASD1Q9Y272 281 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 MOSPD3O75425 235 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 Q6ZS52 159 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC54Q8NEL0 328 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 UBE2FQ969M7 185 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR5M11Q96RB7 305 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ARID2Q68CP9 1835 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 KCNK2O95069 426 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 GPNMBQ14956 572 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 AWAT2Q6E213 333 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 VASNQ6EMK4 673 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CHST8Q9H2A9 424 aa15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZAR1LA6NP61 321 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 A8MVM7 634 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 GLB1P16278 677 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 GDF1P27539 372 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RBMXP38159 391 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC2A12Q8TD20 617 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TNFRSF10AO00220 468 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 HSPA12AO43301 675 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FCMRO60667 390 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CSO75390 466 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 MSX1P28360 303 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PPICP45877 212 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 IHHQ14623 411 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 LMF1Q96S06 567 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 DUSP21Q9H596 190 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ELOVL3Q9HB03 270 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NUP50Q9UKX7 468 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SOCS6O14544 535 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PIP5K1CO60331 668 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 POU3F4P49335 361 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 VAMP2P63027 116 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SIRPAP78324 504 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 KCTD9Q7L273 389 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF566Q969W8 418 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NMNAT3Q96T66 252 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 POLHQ9Y253 713 aa15.23■□□□□ 0.03
ITGA3-202ENST00000320031 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms