RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ITFG2Q969R8 447 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 APOOQ9BUR5 198 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 E7ESA3 106 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 GPR32O75388 356 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 TUSC2O75896 110 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 RGS11O94810 467 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 KCNJ8Q15842 424 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 OR8U8P0C7N1 319 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 RAB6AP20340 208 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CDONQ4KMG0 1287 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CDS1Q92903 461 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 DTD2Q96FN9 168 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 INPP5KQ9BT40 448 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 C5AR2Q9P296 337 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 TNFSF12O43508 249 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SUSD5O60279 629 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CA3P07451 260 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 GIFP27352 417 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 COX15Q7KZN9 410 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 OPRD1P41143 372 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 NOX3Q9HBY0 568 aa8.71□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 MROH6A6NGR9 719 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 GABRR3A8MPY1 467 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SPINT2O43291 252 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 HCRTO43612 131 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 HTR2CP28335 458 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 IKZF1Q13422 519 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 TAZQ16635 292 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 HRH4Q9H3N8 390 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 LPAL2Q16609 132 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 USF3Q68DE3 2245 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 UBE2KP61086 200 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 GAREM2Q75VX8 874 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 NFYBP25208 207 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 RAB35Q15286 201 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 TMEM163Q8TC26 289 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 EBF1Q9UH73 591 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 PLA2G7Q13093 441 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 METTL15A6NJ78 407 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 YY2O15391 372 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 HLA-DMAP28067 261 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 GJA5P36382 358 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SPOCK1Q08629 439 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 MOGSQ13724 837 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 DOK4Q8TEW6 326 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SLC6A18Q96N87 628 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 CD300AQ9UGN4 299 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.71□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 DLX5P56178 289 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 RAB38P57729 211 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 LCN10Q6JVE6 187 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 NAGSQ8N159 534 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SLC16A7O60669 478 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 CLDN2P57739 230 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 LHPPQ9H008 270 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 CNIH1O95406 144 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 ARSDP51689 593 aa8.7□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms