RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 EFNB1P98172 346 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FOXK2Q01167 660 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CRMP1Q14194 572 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 MDGA2Q7Z553 956 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 OR52L1Q8NGH7 329 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NR4A3Q92570 626 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 MYDGFQ969H8 173 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FKBP10Q96AY3 582 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SGTBQ96EQ0 304 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TAAR9Q96RI9 348 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 WDR54Q9H977 334 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PCSK5Q92824 1860 aa9.98□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PRR33A8MZF0 331 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 B4E171 279 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PTP4A3O75365 173 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CXCR1P25024 350 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 ATP6V1E1P36543 226 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TSPAN7P41732 249 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SLC1A3P43003 542 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CDH11P55287 796 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NCS1P62166 190 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SPCS2Q15005 226 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CMIPQ8IY22 773 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FGF11Q92914 225 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PTP4A1Q93096 173 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 LGALS12Q96DT0 336 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TSSK2Q96PF2 358 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CD36P16671 472 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 DLSTP36957 453 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TIGD6Q17RP2 521 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FAM26EQ8N5C1 309 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 ELP5Q8TE02 316 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TP53INP1Q96A56 240 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NEURL2Q9BR09 285 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 LAT2Q9GZY6 243 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FANCFQ9NPI8 374 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SPEF1Q9Y4P9 236 aa9.97□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 ONECUT2O95948 504 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CTRB1P17538 263 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 AHCYP23526 432 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 IL32P24001 234 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 BCAP31P51572 246 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CTBP2P56545 445 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CSRP2Q16527 193 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 LYPD8Q6UX82 237 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 OR5W2Q8NH69 310 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NUBPLQ8TB37 319 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NDNFQ8TB73 568 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 HGDQ93099 445 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM203Q969S6 136 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 ARL5BQ96KC2 179 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NMNAT3Q96T66 252 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NANSQ9NR45 359 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM64BA6NI03 449 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 FTH1P19P0C7X4 201 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 SLC15A1P46059 708 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 MTNR1AP48039 350 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 GPR85P60893 370 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CHAF1BQ13112 559 aa9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms