RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276410.6

CHRNA6-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA6, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6-201ENST00000276410 NPTNQ9Y639 398 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SIGLEC5O15389 551 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 FGF17O60258 216 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 STX11O75558 287 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 CPMP14384 443 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 NAT1P18440 290 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 CMPK1P30085 196 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SIRPAP78324 504 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PITPNAQ00169 270 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM53BQ14153 422 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 EIPR1Q53HC9 387 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 FHL5Q5TD97 284 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 CMIPQ8IY22 773 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SNX33Q8WV41 574 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 LCN9Q8WX39 176 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 MYADMQ96S97 322 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 APOOQ9BUR5 198 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 GSX2Q9BZM3 304 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 INPP5EQ9NRR6 644 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 GDE1Q9NZC3 331 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 COPZ2Q9P299 210 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.13□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 OGG1O15527 345 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 ATP1B1P05026 303 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 THBS1P07996 1170 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 CD53P19397 219 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 GABRA3P34903 492 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 ADPRHP54922 357 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 KIAA1024LP59773 190 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 RAB14P61106 215 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 BTN1A1Q13410 526 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 IKZF1Q13422 519 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 TRAM1Q15629 374 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 HACD4Q5VWC8 232 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 OTPQ5XKR4 325 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PAQR7Q86WK9 346 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 OR10G6Q8NH81 332 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 RASD2Q96D21 266 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 NMNAT3Q96T66 252 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PBX4Q9BYU1 374 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 REG4Q9BYZ8 158 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 A0A1B0GTH9 108 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PRSS38A1L453 326 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 RPP14O95059 124 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PVRP15151 417 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 COL9A1P20849 921 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 DPP4P27487 766 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SOX2P48431 317 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 PTH2RP49190 550 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 DYRK1AQ13627 763 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 HTR4Q13639 388 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 KCNAB1Q14722 419 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 NNATQ16517 81 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 GPAT4Q86UL3 456 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC51BQ86UW2 128 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 CDK20Q8IZL9 346 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 TEX19Q8NA77 164 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.12□□□□□ -0.95
CHRNA6-201ENST00000276410 COQ8AQ8NI60 647 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms