RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023154.2

Cldn1-201, Transcript of Claudin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn1, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cisd3B1AR13 137 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Btbd16E9Q173 522 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 H2-ObO35424 271 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nfkbil1O88995 381 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fgf3P05524 245 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nr4a1P12813 601 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cma1P21844 247 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hoxa2P31245 372 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Alox12eP55249 662 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tbx5P70326 518 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Klhl6Q6V595 619 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1065Q7TR70 313 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Luzp2Q8BGY3 345 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tm9sf4Q8BH24 643 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pi15Q8BS03 258 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Synpo2lQ8BWB1 975 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rhbdl1Q8VC82 373 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr683Q8VGV1 319 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Spred1Q924S8 444 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem186Q9CR76 216 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem53Q9D0Z3 276 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ankrd22Q9D3J5 191 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Brix1Q9DCA5 353 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc7a5Q9Z127 512 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mfsd13bA0A1L1SUA2 455 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rhox2fA2ANE0 191 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr544E9PX47 334 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr723E9PZU2 309 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm10260F6YVP7 152 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 S100a2J3QMC7 104 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr190K7N5T5 307 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr724K7N5X7 309 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr618K7N6B3 318 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Grap2O89100 322 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MyogP12979 224 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Wnt4P22724 351 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tnfrsf1bP25119 474 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Klk1b26P36369 261 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc1a3P56564 543 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Itgb8Q0VBD0 767 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Spata13Q5DU57 656 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ldoc1Q7TPY9 151 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slitrk4Q810B8 837 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cox15Q8BJ03 413 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Iglon5Q8HW98 336 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Unc5dQ8K1S2 956 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hemk1Q921L7 340 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Klhl22Q99JN2 634 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Desi1Q9CQT7 168 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Smim23Q9DAL0 136 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ethe1Q9DCM0 254 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Clec3aQ9EPW4 196 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pole3Q9JKP7 145 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Skp2Q9Z0Z3 424 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lrit3W8DXL4 681 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1366A0A1W2P740 328 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cd101A8E0Y8 1033 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm21904A8HG57 180 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Chrna10B2RX82 447 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm5478D3Z6R0 159 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 BC051665E9Q623 330 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm21897J3KMP5 500 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm21866J3QMH4 180 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm21750L7N228 499 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cx3cl1O35188 395 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P06336 421 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sod1P08228 154 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pou3f4P62515 361 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 BglapP86546 95 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Bglap2P86547 95 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CpeQ00493 476 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vmn1r11Q3SXA2 299 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ptp4a1Q63739 173 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Grm7Q68ED2 915 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem158Q6F5E0 286 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ntf4Q80VU4 209 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Plekhm3Q8BM47 761 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 IrgcQ8C262 412 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 TifabQ8JZM6 147 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mboat2Q8R3I2 519 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr510Q8VEW6 314 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr651Q8VG78 313 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gpx4Q91XR9 253 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ucn3Q924A4 164 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Edem1Q925U4 652 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cdca4Q9CWM2 237 aa8.39□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.2 ms