RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc15a1Q9JIP7 709 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2afb1S4R1E0 115 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cacna1eQ61290 2272 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Smpd5D6MZJ6 483 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 DxoO70348 397 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nfatc1O88942 717 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 FhitO89106 150 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fgf3P05524 245 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 NelfeP19426 375 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 GhrhrP32082 423 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Oprd1P32300 372 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fpr1P33766 364 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc11a1P41251 548 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wnt11P48615 354 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 TsxP70675 144 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 UradQ283N4 178 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc22a20Q80UJ1 556 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 SnupnQ80W37 358 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rhox11Q810N8 206 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mnd1Q8K396 205 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem5Q8VDX6 444 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chmp1b2Q9CQD4 199 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdca4Q9CWM2 237 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cst11Q9D269 139 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem35aQ9D328 167 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Asb12Q9D738 308 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Spaca1Q9DA48 305 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Uchl1Q9R0P9 223 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vps13aQ5H8C4 3166 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cacng2O88602 323 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pou2f1P25425 770 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxo31Q3TQF0 507 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 TfptQ3U1J1 259 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lin54Q571G4 749 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Clec4a4Q5YIR8 236 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Jazf1Q80ZQ5 243 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eif1axQ8BMJ3 144 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Akr1c18Q8K023 323 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Etv3Q8R4Z4 513 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Papd4Q91YI6 484 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Abcg5Q99PE8 652 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Natd1Q9DBW3 110 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdc40Q9DC48 579 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 NcdnQ9Z0E0 729 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr179E9PY61 2293 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 TprF6ZDS4 2431 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Amd2D3Z6H8 334 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2-T3P14432 384 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 MagP20917 626 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nrg2P56974 756 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc12a3P59158 1002 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppp1caP62137 330 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pou3f4P62515 361 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fgf17P63075 216 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc27a5Q4LDG0 689 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Muc19Q6JHY2 733 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp180Q6NZI9 655 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Morn4Q6PGF2 146 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21627Q810R0 219 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pced1bQ8BGX1 433 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm9881Q8BR56 211 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eipr1Q8K0G5 386 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 AspaQ8R3P0 312 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eps8l3Q91WL0 600 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc41a3Q921R8 488 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chmp1aQ921W0 196 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chp2Q9D869 196 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc37a4A0A1L1SUI3 450 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5799E9Q2M1 201 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cldn34aG3UW52 211 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sstr5O08858 362 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ctla4P09793 223 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nr4a1P12813 601 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 PvalbP32848 110 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arf3P61205 181 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rras2P62071 204 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 St3gal3P97325 374 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 AmbpQ07456 349 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pgap2Q3TQR0 254 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm906Q3V0M1 1017 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Surf4Q64310 269 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rdh10Q8VCH7 341 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Epsti1Q8VDI1 314 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr518Q8VEW1 333 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1043Q8VFK4 314 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dapl1Q9D757 107 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r48Q9EQ52 302 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm15013V9GWY0 266 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa10.63□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kif26bQ7TNC6 2112 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.6 ms