RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NECTIN2Q92692 538 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 LRP10Q7Z4F1 713 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 SP8Q8IXZ3 490 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA2012Q0VF49 1180 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TNIP1Q15025 636 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SAPCD2Q86UD0 394 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 CDHR2Q9BYE9 1310 aa35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPM7Q96QT4 1865 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 RIPK4P57078 832 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 COPS6Q7L5N1 327 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP10Q86W26 655 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 XAGE3Q8WTP9 111 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 GRAPQ13588 217 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP44Q96MT7 982 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPM4Q8TD43 1214 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-217ENST00000629983 CA12O43570 354 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC37L1Q7L3B6 337 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3TC1Q8TE82 1336 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF428Q96B54 188 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C1D1 291 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 HHIPL1Q96JK4 782 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 PGAP2Q9UHJ9 254 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TCIRG1Q13488 830 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MICALL2Q8IY33 904 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 SHTN1A0MZ66 631 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-217ENST00000629983 YDJCA8MPS7 323 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC4Q7Z404 712 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 USP48Q86UV5 1035 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 MCOLN1Q9GZU1 580 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 HUNKP57058 714 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 WASHC4Q2M389 1173 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DBNDD1Q9H9R9 158 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 NOGQ13253 232 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD14O00487 310 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 RIMBP2O15034 1052 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKZQ13574 1117 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD7Q7Z3H4 446 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMB2P55268 1798 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf229H3BNL8 230 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 NEUROD2Q15784 382 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT24Q2M2I5 525 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CHPF2Q9P2E5 772 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC34A2O95436 690 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DLK2Q6UY11 383 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DUOX1Q9NRD9 1551 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS19P49795 217 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT26Q7Z3Y9 468 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DPF2Q92785 391 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM89AQ96GI7 184 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZIC5Q96T25 663 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PLBD2Q8NHP8 589 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ECE2O60344 883 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 DOK7Q18PE1 504 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf69Q8N8R5 385 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 EYA3Q99504 573 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 GPSM2P81274 684 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 RGMBQ6NW40 437 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ADM5C9JUS6 153 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS12P25398 132 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 POLLQ9UGP5 575 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 EGFRP00533 1210 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 CHL1O00533 1208 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ISCA1Q9BUE6 129 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC37AA6NMS7 1700 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF1P21675 1872 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 G3V3G9 751 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF8Q5TAQ9 597 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNQ5Q9NR82 932 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RALBP1Q15311 655 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC102AQ96A19 550 aa35.62■■■■□ 3.29
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