RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 PPIP5K2O43314 1243 aa37.18■■■■□ 3.54
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SEMA3B-215ENST00000621029 MPNDQ8N594 471 aa37.18■■■■□ 3.54
SEMA3B-215ENST00000621029 SUPT20HQ8NEM7 779 aa37.18■■■■□ 3.54
SEMA3B-215ENST00000621029 MYH16Q9H6N6 1097 aa37.18■■■■□ 3.54
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SEMA3B-215ENST00000621029 NIM1KQ8IY84 436 aa37.17■■■■□ 3.54
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SEMA3B-215ENST00000621029 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
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SEMA3B-215ENST00000621029 FLIIQ13045 1269 aa37.11■■■■□ 3.53
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SEMA3B-215ENST00000621029 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
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SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC152Q4G0S7 254 aa37.08■■■■□ 3.53
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SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
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SEMA3B-215ENST00000621029 COL4A5P29400 1685 aa37.08■■■■□ 3.53
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SEMA3B-215ENST00000621029 RPS8P62241 208 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SEC31BQ9NQW1 1179 aa37.06■■■■□ 3.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TAF1P21675 1872 aa37.05■■■■□ 3.52
SEMA3B-215ENST00000621029 EPHX2P34913 555 aa37.05■■■■□ 3.52
SEMA3B-215ENST00000621029 CLEC11AQ9Y240 323 aa37.05■■■■□ 3.52
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SEMA3B-215ENST00000621029 KIAA2012Q0VF49 1180 aa37.03■■■■□ 3.52
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SEMA3B-215ENST00000621029 C6orf229H3BNL8 230 aa37.02■■■■□ 3.52
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SEMA3B-215ENST00000621029 GPSM2P81274 684 aa37■■■■□ 3.51
SEMA3B-215ENST00000621029 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
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SEMA3B-215ENST00000621029 LINS1Q8NG48 757 aa36.96■■■■□ 3.51
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa36.96■■■■□ 3.51
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SEMA3B-215ENST00000621029 COL4A1P02462 1669 aa36.94■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 H7C1W4 665 aa36.94■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 CIAPIN1Q6FI81 312 aa36.94■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 POLLQ9UGP5 575 aa36.94■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 EPS15P42566 896 aa36.93■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 SCNN1DP51172 638 aa36.93■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 TNIP1Q15025 636 aa36.93■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC37AA6NMS7 1700 aa36.93■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 F6X3S4 739 aa36.92■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 TTLL11Q8NHH1 800 aa36.92■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D16Q8TBP0 767 aa36.92■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 KLRG1Q96E93 195 aa36.91■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL2L13Q9BXK5 485 aa36.91■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 DUOX1Q9NRD9 1551 aa36.91■■■■□ 3.5
SEMA3B-215ENST00000621029 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
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SEMA3B-215ENST00000621029 E9PSI1 815 aa36.89■■■■□ 3.5
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SEMA3B-215ENST00000621029 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 DOK7Q18PE1 504 aa36.87■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 PODXL2Q9NZ53 605 aa36.87■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 GPRC5DQ9NZD1 345 aa36.87■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 YDJCA8MPS7 323 aa36.86■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 CACNA1FO60840 1977 aa36.86■■■■□ 3.49
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