RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	N4BP3	O15049	544 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	FOXO3	O43524	673 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CAPN2	P17655	700 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	NCOA7	Q8NI08	942 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ATP2B2	Q01814	1243 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	G2E3	Q7L622	706 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	JADE2	Q9NQC1	790 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806		A0A1W2PP64	1363 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	BRD1	O95696	1058 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ERO1A	Q96HE7	468 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CTAGE8	P0CG41	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	SPTLC2	O15270	562 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	TUBB4A	P04350	444 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	NEFH	P12036	1026 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CHST3	Q7LGC8	479 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	GPT2	Q8TD30	523 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	PHACTR2	O75167	634 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CBX8	Q9HC52	389 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	MNAT1	P51948	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ALG1	Q9BT22	464 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	GOLGA1	Q92805	767 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ELF2	Q15723	593 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	IVL	P07476	585 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	AFM	P43652	599 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF75D	P51815	510 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	KANK3	Q6NY19	840 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	VPS18	Q9P253	973 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806		A0A1B0GVL5	298 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	GRM8	O00222	908 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC175	P0C221	793 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	MAP3K12	Q12852	859 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	NLRP5	P59047	1200 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	EVC	P57679	992 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	FANCA	O15360	1455 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ZMYM3	Q14202	1370 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CD109	Q6YHK3	1445 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	IQCA1	Q86XH1	822 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	SGSM2	O43147	1006 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	CEP112	Q8N8E3	955 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	WDR62	O43379	1518 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	ALDH1L1	O75891	902 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		12.83	□□□□□ -0.36

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