RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606170.1

PRDM16-209, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

TSL 4

Gene PRDM16, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-209ENST00000606170 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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PRDM16-209ENST00000606170 PPIP5K2O43314 1243 aa21.55■■□□□ 1.04
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PRDM16-209ENST00000606170 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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PRDM16-209ENST00000606170 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PRDM16-209ENST00000606170 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.54■■□□□ 1.04
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PRDM16-209ENST00000606170 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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PRDM16-209ENST00000606170 TMC4Q7Z404 712 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM16-209ENST00000606170 GPC2Q8N158 579 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM16-209ENST00000606170 COL4A5P29400 1685 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM16-209ENST00000606170 TAF1P21675 1872 aa21.52■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 PDE8AO60658 829 aa21.51■■□□□ 1.03
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PRDM16-209ENST00000606170 POTEJP0CG39 1038 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 HTRA3P83110 453 aa21.51■■□□□ 1.03
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PRDM16-209ENST00000606170 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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PRDM16-209ENST00000606170 VPS33BQ9H267 617 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 HACL1Q9UJ83 578 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 CHADLQ6NUI6 762 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 EPHX2P34913 555 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 LDHDQ86WU2 507 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 ZNF521Q96K83 1311 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 COL4A1P02462 1669 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 SCN4AP35499 1836 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM16-209ENST00000606170 C6orf229H3BNL8 230 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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PRDM16-209ENST00000606170 GPSM2P81274 684 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 WASHC4Q2M389 1173 aa21.44■■□□□ 1.02
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PRDM16-209ENST00000606170 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.44■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 RIMBP2O15034 1052 aa21.43■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 SCNN1DP51172 638 aa21.43■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 CXCL9Q07325 125 aa21.43■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 GCKRQ14397 625 aa21.43■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.43■■□□□ 1.02
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PRDM16-209ENST00000606170 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.43■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 F6X3S4 739 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 H7C1W4 665 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 RAD17O75943 681 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 LINS1Q8NG48 757 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 EPS15P42566 896 aa21.41■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.41■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.41■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRDM16-209ENST00000606170 EYA3Q99504 573 aa21.41■■□□□ 1.02
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PRDM16-209ENST00000606170 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.4■■□□□ 1.02
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PRDM16-209ENST00000606170 E9PSI1 815 aa21.39■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 UFL1O94874 794 aa21.39■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 TNIP1Q15025 636 aa21.39■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 KLRG1Q96E93 195 aa21.39■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 CACNA1FO60840 1977 aa21.38■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 DOK7Q18PE1 504 aa21.38■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.38■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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PRDM16-209ENST00000606170 GGA1Q9UJY5 639 aa21.38■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 LTBP1Q14766 1721 aa21.38■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 CASP7P55210 303 aa21.37■■□□□ 1.01
PRDM16-209ENST00000606170 BEND3Q5T5X7 828 aa21.37■■□□□ 1.01
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