RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 ZIC5Q96T25 663 aa18.63■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 ERBB4Q15303 1308 aa18.63■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 ECE1P42892 770 aa18.62■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 RIPK4P57078 832 aa18.62■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 FAM161AQ3B820 660 aa18.62■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 MPNDQ8N594 471 aa18.62■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.62■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 VPS33BQ9H267 617 aa18.62■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 LAMB2P55268 1798 aa18.62■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.61■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 BBOX1O75936 387 aa18.61■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.6■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.6■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 TCIRG1Q13488 830 aa18.6■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.6■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 MAP2K2P36507 400 aa18.59■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.58■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 COL4A1P02462 1669 aa18.58■□□□□ 0.57
FCHO1-228ENST00000599236 EGFRP00533 1210 aa18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 GRAPQ13588 217 aa18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 USP48Q86UV5 1035 aa18.57■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.57■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.57■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.57■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.56■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.56■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 RGS19P49795 217 aa18.55■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 TNIP1Q15025 636 aa18.55■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 PSMD14O00487 310 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 CHL1O00533 1208 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 RIMBP2O15034 1052 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 NEUROD2Q15784 382 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 MICALL2Q8IY33 904 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 FAM89AQ96GI7 184 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 POLLQ9UGP5 575 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.53■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.53■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.53■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.53■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 GPSM2P81274 684 aa18.52■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.52■□□□□ 0.56
FCHO1-228ENST00000599236 H7C1D1 291 aa18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 DOK7Q18PE1 504 aa18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 SLC34A2O95436 690 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 HUNKP57058 714 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 WASHC4Q2M389 1173 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 DPF2Q92785 391 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 RTL9Q8NET4 1388 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 ADM5C9JUS6 153 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 SCN9AQ15858 1988 aa18.48■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 C6orf229H3BNL8 230 aa18.48■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.48■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 DGKZQ13574 1117 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 CA12O43570 354 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 ECE2O60344 883 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 TMC4Q7Z404 712 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 CFAP44Q96MT7 982 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-228ENST00000599236 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms