RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592446.1

CNP-211, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 4

Gene CNP, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-211ENST00000592446 TMC4Q7Z404 712 aa30.18■■■□□ 2.42
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CNP-211ENST00000592446 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 CACNA1SQ13698 1873 aa30.18■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.17■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 IGKV5-2P06315 115 aa30.17■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.17■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 VPS33BQ9H267 617 aa30.17■■■□□ 2.42
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CNP-211ENST00000592446 FLIIQ13045 1269 aa30.14■■■□□ 2.42
CNP-211ENST00000592446 NIM1KQ8IY84 436 aa30.14■■■□□ 2.42
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CNP-211ENST00000592446 H7C1W4 665 aa30.05■■■□□ 2.4
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CNP-211ENST00000592446 EPS15P42566 896 aa30■■■□□ 2.39
CNP-211ENST00000592446 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30■■■□□ 2.39
CNP-211ENST00000592446 COL4A1P02462 1669 aa30■■■□□ 2.39
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CNP-211ENST00000592446 PASKQ96RG2 1323 aa29.95■■■□□ 2.38
CNP-211ENST00000592446 GGA1Q9UJY5 639 aa29.94■■■□□ 2.38
CNP-211ENST00000592446 RTL9Q8NET4 1388 aa29.93■■■□□ 2.38
CNP-211ENST00000592446 UFL1O94874 794 aa29.93■■■□□ 2.38
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CNP-211ENST00000592446 DOK7Q18PE1 504 aa29.93■■■□□ 2.38
CNP-211ENST00000592446 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CNP-211ENST00000592446 CNTROBQ8N137 903 aa29.93■■■□□ 2.38
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