RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590599.1

CTDP1-205, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 1,762 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-205ENST00000590599 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 SUSD4Q5VX71 490 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 SYNE4Q8N205 404 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 FAM177BA6PVY3 158 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 ADRA2BP18089 450 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 MX1P20591 662 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 RFC4P35249 363 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 TTC22Q5TAA0 569 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-205ENST00000590599 LAMB2P55268 1798 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 PDE1AP54750 535 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 CTSWP56202 376 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 PDE8AO60658 829 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 NTSR2O95665 410 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 CSF1RP07333 972 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 SASH1O94885 1247 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 SSFA2P28290 1259 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 STAP2Q9UGK3 403 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 SETDB2Q96T68 719 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 AOX1Q06278 1338 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 AACSQ86V21 672 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 KLHL34Q8N239 644 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 SYT17Q9BSW7 474 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-205ENST00000590599 CIAO1O76071 339 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 GPATCH3Q96I76 525 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 NYXQ9GZU5 481 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 GREM2Q9H772 168 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 EYA2O00167 538 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 ITGA6P23229 1130 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 TFCP2Q12800 502 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 FBXO3Q9UK99 471 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 CDC45O75419 566 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 SDSP20132 328 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 ERFEQ4G0M1 354 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 LRRC24Q50LG9 513 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 ERC2O15083 957 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 POLD1P28340 1107 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 TNNI3KQ59H18 835 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-205ENST00000590599 RTL9Q8NET4 1388 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 NPHP1O15259 732 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 SEC24BO95487 1268 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 NFIXQ14938 502 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 GPR108Q9NPR9 543 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 ABCC12Q96J65 1359 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 GYS1P13807 737 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 CASC1Q6TDU7 716 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-205ENST00000590599 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.12■■□□□ 1.13
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