RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 PDIA6Q15084 440 aa21.3■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.29■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.29■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 USP48Q86UV5 1035 aa21.29■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.29■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.28■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 NLRP3Q96P20 1036 aa21.28■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.28■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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PTPRS-208ENST00000590509 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 CA12O43570 354 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 SP8Q8IXZ3 490 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 MPNDQ8N594 471 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
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PTPRS-208ENST00000590509 VPS33BQ9H267 617 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 SOX10P56693 466 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 HUNKP57058 714 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 MICALL2Q8IY33 904 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 PARP10Q53GL7 1025 aa21.23■□□□□ 0.99
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PTPRS-208ENST00000590509 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
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PTPRS-208ENST00000590509 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 PSMD14O00487 310 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 BBOX1O75936 387 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 NOGQ13253 232 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 NLRP10Q86W26 655 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 NECTIN2Q92692 538 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRS-208ENST00000590509 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 NFE2L2Q16236 605 aa21.2■□□□□ 0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 GRAPQ13588 217 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 TNIP1Q15025 636 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.19■□□□□ 0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 SCN9AQ15858 1988 aa21.19■□□□□ 0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.17■□□□□ 0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 TRPA1O75762 1119 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 POLLQ9UGP5 575 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 DOK7Q18PE1 504 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 DPF2Q92785 391 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 CSRNP1Q96S65 589 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.14■□□□□ 0.98
PTPRS-208ENST00000590509 GPSM2P81274 684 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 TCIRG1Q13488 830 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.12■□□□□ 0.97
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PTPRS-208ENST00000590509 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 MOB2Q70IA6 237 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 C6orf229H3BNL8 230 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC102AQ96A19 550 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 CDCA5Q96FF9 252 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRS-208ENST00000590509 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRS-208ENST00000590509 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
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