RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RETREG3Q86VR2 466 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA32Q96LK8 384 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 EVC2Q86UK5 1308 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 AXIN1O15169 862 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 LYPD8Q6UX82 237 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SBNO1A3KN83 1393 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 CABP1Q9NZU7 370 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ACEP12821 1306 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RXRBP28702 533 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 AFF2P51816 1311 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 NCOA4Q13772 614 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 HPS1Q92902 700 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 USP21Q9UK80 565 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 PXDNQ92626 1479 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 JUNDP17535 347 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM50Q86XT4 487 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 GPSM3Q9Y4H4 160 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 CTC1Q2NKJ3 1217 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TREML4Q6UXN2 200 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ABTB2Q8N961 1025 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ASB16Q96NS5 453 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 SHPRHQ149N8 1683 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF10O15013 1369 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM83GA6ND36 823 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ICMTO60725 284 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RECKO95980 971 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP1A2P50993 1020 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 DPYDQ12882 1025 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 NAALADL2Q58DX5 795 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP13Q86W25 1043 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRB2O60241 1585 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 LRP6O75581 1613 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 OGFOD1Q8N543 542 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TMC1Q8TDI8 760 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF1AQ12756 1690 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 EML3Q32P44 896 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-216ENST00000590105 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.46□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 USP32Q8NFA0 1604 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 TMF1P82094 1093 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE2CQ5TA81 110 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 TESK2Q96S53 571 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP7BP35670 1465 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 TERF2IPQ9NYB0 399 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 GCP02774 474 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SIX5Q8N196 739 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 C21orf2O43822 256 aa10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 MAPK1P28482 360 aa10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 WNT7BP56706 349 aa10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 EVA1CP58658 441 aa10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms