RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF516Q92618 1163 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR14Q9BWN1 585 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 TSKSQ9UJT2 592 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 F6X3S4 739 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 PDIA6Q15084 440 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 PANK1Q8TE04 598 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 RLBP1P12271 317 aa7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNRD1Q16881 649 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CRBNQ96SW2 442 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 RREB1Q92766 1687 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 C4BP0C0L5 1744 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM27P14373 513 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS12P56730 875 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 FLIIQ13045 1269 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF827Q17R98 1081 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRYD7Q5W111 196 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 COPS6Q7L5N1 327 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ARXQ96QS3 562 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 STK31Q9BXU1 1019 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K7O43318 606 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXB7P09629 217 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 SLF2Q8IX21 1173 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TATDN2Q93075 761 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 COG6Q9Y2V7 657 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCY9O60503 1353 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.69□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 GNPATO15228 680 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ZPR1O75312 459 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 WFS1O76024 890 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 STARD3NLO95772 234 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 APLP1P51693 650 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMK2BQ13554 666 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.68□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 C4AP0C0L4 1744 aa7.67□□□□□ -1.18
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CAPNS1-208ENST00000589162 POTECB2RU33 542 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 WIPF1O43516 503 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 HLFQ16534 295 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF16BQ96L93 1317 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM187AA6NFU0 413 aa7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 BAG6P46379 1132 aa7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-208ENST00000589162 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.66□□□□□ -1.18
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