RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMOD3Q9NYL9 352 aa19.77■□□□□ 0.76
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUP98P52948 1817 aa19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1B0GUL7 405 aa19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
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