RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 SLC24A1O60721 1099 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 GRIK4Q16099 956 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 CEP63Q96MT8 703 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 BRD7Q9NPI1 651 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC7Q96M83 1385 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 KCNQ4P56696 695 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 POTEAQ6S8J7 498 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 NACC1Q96RE7 527 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 DAPK1P53355 1430 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 IFT140Q96RY7 1462 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 SFI1A8K8P3 1242 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 TYRO3Q06418 890 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM50Q86XT4 487 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 CLDN10P78369 228 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC102BQ68D86 513 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 POM121Q96HA1 1249 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 SELPP16109 830 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ARTNQ5T4W7 220 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 BHMTQ93088 406 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 SUSD3Q96L08 255 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA0556O60303 1618 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ADGRL2O95490 1459 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ADGRE1Q14246 886 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 MBTPS1Q14703 1052 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ABCC5O15440 1437 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 A0A0A0MRY4 1105 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L3A6NCW0 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L4A6NCW7 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 C9orf172C9J069 976 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 LILRB5O75023 590 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ATP1A2P50993 1020 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 MRS2Q9HD23 443 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 POM121CA8CG34 1229 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 M0R2N6 131 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 C21orf2O43822 256 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ELNP15502 786 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 UCN2Q96RP3 112 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 KIF14Q15058 1648 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRM-212ENST00000580838 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.78□□□□□ -1.16
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