RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578552.5

GPS1-208, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPS1, Length 1,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-208ENST00000578552 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-208ENST00000578552 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-208ENST00000578552 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-208ENST00000578552 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 CTSWP56202 376 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 POLA2Q14181 598 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 CNBD1Q8NA66 436 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 SSH3Q8TE77 659 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 PDE8AO60658 829 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 MTX1Q13505 466 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 RGL2O15211 777 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 CACNA1SQ13698 1873 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 CSF1RP07333 972 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 NYXQ9GZU5 481 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 ITGA6P23229 1130 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GPS1-208ENST00000578552 DCTPP1Q9H773 170 aa20.21■□□□□ 0.83
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GPS1-208ENST00000578552 LRRC24Q50LG9 513 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 SMC5Q8IY18 1101 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.19■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 LNPKQ9C0E8 428 aa20.19■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.19■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 HMMRO75330 724 aa20.18■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.18■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 PDE4AP27815 886 aa20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 ST5P78524 1137 aa20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 SASH1O94885 1247 aa20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 RGS3P49796 1198 aa20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 NLRP3Q96P20 1036 aa20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.16■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.15■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.15■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 LRP5O75197 1615 aa20.15■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 A0A1B0GUL6 1792 aa20.14■□□□□ 0.82
GPS1-208ENST00000578552 SNAP23O00161 211 aa20.14■□□□□ 0.81
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GPS1-208ENST00000578552 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.14■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 COPRSQ9NQ92 184 aa20.14■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 CHRNA5P30532 468 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 GCC1Q96CN9 775 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 NUCB1Q02818 461 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 BACH2Q9BYV9 841 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.13■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 TFCP2Q12800 502 aa20.12■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 MTFR1LQ9H019 292 aa20.12■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.11■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.11■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 12.2
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GPS1-208ENST00000578552 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.11■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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GPS1-208ENST00000578552 KLHL34Q8N239 644 aa20.1■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.1■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.1■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 PTGER2P43116 358 aa20.09■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.09■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 TAF5LO75529 589 aa20.09■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.09■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.09■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.08■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 SLX4Q8IY92 1834 aa20.08■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.08■□□□□ 0.81
GPS1-208ENST00000578552 RTL9Q8NET4 1388 aa20.08■□□□□ 0.8
GPS1-208ENST00000578552 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.08■□□□□ 0.8
GPS1-208ENST00000578552 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GPS1-208ENST00000578552 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GPS1-208ENST00000578552 SRGNP10124 158 aa20.07■□□□□ 0.8
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