RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577887.1

SNORD53B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53B, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53B-201ENST00000577887 PDE8AO60658 829 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 UFL1O94874 794 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 HOXB7P09629 217 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ATP2B4P23634 1241 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PPP2R1AP30153 589 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 EPS15P42566 896 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TNNI2P48788 182 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 GNAI1P63096 354 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 FKBP1BP68106 108 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 DCTN1Q14203 1278 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CCDC57Q2TAC2 916 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 FAM161AQ3B820 660 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CYP4F22Q6NT55 531 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 RGMBQ6NW40 437 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 COPS6Q7L5N1 327 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 USP17L1Q7RTZ2 530 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ZNF804AQ7Z570 1209 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 AMIGO3Q86WK7 504 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 MICALL2Q8IY33 904 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 IL17REQ8NFR9 667 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PLBD2Q8NHP8 589 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 DPF2Q92785 391 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 RUNDC1Q96C34 613 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ABHD8Q96I13 439 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 HHIPL1Q96JK4 782 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TMEM106CQ9BVX2 250 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ANKRD2Q9GZV1 360 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 RSPH6AQ9H0K4 717 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 WBP1LQ9NX94 342 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 SAGE1Q9NXZ1 904 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 MIS18AQ9NYP9 233 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 GPRC5DQ9NZD1 345 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TMOD2Q9NZR1 351 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PCDH10Q9P2E7 1040 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TLL2Q9Y6L7 1015 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 XDHP47989 1333 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PASKQ96RG2 1323 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ZNF541Q9H0D2 1346 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 KIF13BQ9NQT8 1826 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PSMD14O00487 310 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ECE2O60344 883 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TRPA1O75762 1119 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 USP17L8P0C7I0 530 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 HOXD10P28358 340 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TMPOP42166 694 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 IREB2P48200 963 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 INHBEP58166 350 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 RPS8P62241 208 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CXCL9Q07325 125 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 KIAA2012Q0VF49 1180 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 DLGAP5Q15398 846 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 HLFQ16534 295 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CRY2Q49AN0 593 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CAVIN4Q5BKX8 364 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 SUSD4Q5VX71 490 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PODNQ7Z5L7 613 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 SAPCD2Q86UD0 394 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 USP48Q86UV5 1035 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CCDC191Q8NCU4 936 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 AGBL3Q8NEM8 1001 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 XAGE3Q8WTP9 111 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 SLC10A4Q96EP9 437 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 FAM89AQ96GI7 184 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 ERO1AQ96HE7 468 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PHACTR3Q96KR7 559 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 TRIM34Q9BYJ4 488 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 DBNDD1Q9H9R9 158 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 MYOZ2Q9NPC6 264 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CNNM1Q9NRU3 951 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 GGA3Q9NZ52 723 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CSADQ9Y600 493 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 MRC1P22897 1456 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa1.99□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa1.98□□□□□ -2.09
SNORD53B-201ENST00000577887 SCN4AP35499 1836 aa1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms