RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 TCIRG1Q13488 830 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 C4BP0C0L5 1744 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 HSPA4P34932 840 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 MCM4P33991 863 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 TNNI3KQ59H18 835 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 GSE1Q14687 1217 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 NEK4P51957 841 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 GBP4Q96PP9 640 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 PTMSP20962 102 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 TFCP2Q12800 502 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 RPS6KA4O75676 772 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 ATP5JP18859 108 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 BAG6P46379 1132 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 GPR108Q9NPR9 543 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 PALD1Q9ULE6 856 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 IL25Q9H293 177 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 CIAO1O76071 339 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS3-204ENST00000575194 NUCB2P80303 420 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 FSD1Q9BTV5 496 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 FBXO3Q9UK99 471 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 GNPATO15228 680 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 ILDR2Q71H61 639 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 AKT1S1Q96B36 256 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 AK7Q96M32 723 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 SNRKQ9NRH2 765 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 EYA2O00167 538 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 SMIM5Q71RC9 77 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 TICAM2Q86XR7 235 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF609O15014 1411 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 NUP98P52948 1817 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 SPEF2Q9C093 1822 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 MYH3P11055 1940 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF827Q17R98 1081 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 TMX3Q96JJ7 454 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-204ENST00000575194 ARXQ96QS3 562 aa22.52■■□□□ 1.2
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SPNS3-204ENST00000575194 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 ADRA2BP18089 450 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 CUL4AQ13619 759 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 MED23Q9ULK4 1368 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 NLRP10Q86W26 655 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 KCNB2Q92953 911 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 CAMTA2O94983 1202 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 SSFA2P28290 1259 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 HLFQ16534 295 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 CSF1RP07333 972 aa22.48■■□□□ 1.19
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