RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUSD4Q5VX71 490 aa35.47■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 SH3TC1Q8TE82 1336 aa35.47■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNQ4P56696 695 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF7LQ5H9L4 462 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 EVI5LQ96CN4 794 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCN7AQ01118 1682 aa35.45■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT27Q7Z3Y8 459 aa35.45■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC24Q50LG9 513 aa35.44■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa35.43■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC4A3P48751 1232 aa35.43■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP5JP18859 108 aa35.42■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 LAMB2P55268 1798 aa35.42■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITGA6P23229 1130 aa35.41■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF2CQ99661 725 aa35.41■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP126Q9P2H0 1117 aa35.41■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 GREM2Q9H772 168 aa35.4■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NARFQ9UHQ1 456 aa35.4■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 NTSR2O95665 410 aa35.39■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D2Q9BYX2 928 aa35.39■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF609O15014 1411 aa35.39■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 C4BP0C0L5 1744 aa35.38■■■■□ 3.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNPATO15228 680 aa35.38■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 DBNDD2Q9BQY9 259 aa35.38■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKAP2Q9Y2D5 859 aa35.38■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIP1O00291 1037 aa35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 BOLA2Q9H3K6 86 aa35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RUFY2Q8WXA3 655 aa35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 SNX21Q969T3 373 aa35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEUROD6Q96NK8 337 aa35.35■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa35.35■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM177BA6PVY3 158 aa35.35■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 SGSM2O43147 1006 aa35.34■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa35.34■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZPR1O75312 459 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 MCCP23508 829 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSCBQ8IWL3 235 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANO2Q9NQ90 1003 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1B0GUL7 405 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RABEP1Q15276 862 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTL9Q8NET4 1388 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIMM10P62072 90 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC152Q4G0S7 254 aa35.31■■■■□ 3.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNNM1Q9NRU3 951 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRP5O75197 1615 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC27A3Q5K4L6 730 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 HAUS7Q99871 368 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RIC1Q4ADV7 1423 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL24Q5JXM2 366 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 FSD1Q9BTV5 496 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 COL24A1Q17RW2 1714 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 C4AP0C0L4 1744 aa35.26■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAPPC3LQ5T215 181 aa35.26■■■■□ 3.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.26■■■■□ 3.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa35.26■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC4BQ9NT99 713 aa35.26■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM37O94972 964 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANAPC15P60006 121 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TICAM2Q86XR7 235 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 SETDB2Q96T68 719 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SPEF2Q9C093 1822 aa35.24■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCC12Q96J65 1359 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP2B3Q16720 1220 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC10A5Q5PT55 438 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 XAGE2Q96GT9 111 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERFEQ4G0M1 354 aa35.21■■■■□ 3.23
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