RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 SP8Q8IXZ3 490 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPIP5K2O43314 1243 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 AOC3Q16853 763 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF521Q96K83 1311 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 FZD9O00144 591 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 MPNDQ8N594 471 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 NIM1KQ8IY84 436 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAMB2P55268 1798 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDE8AO60658 829 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 FSTL1Q12841 308 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL4A5P29400 1685 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR90Q96KV7 1748 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCER2I3L3R5 266 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 POTEIP0CG38 1075 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 POTEJP0CG39 1038 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMC4Q7Z404 712 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL4A1P02462 1669 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-207ENST00000572043 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 F6X3S4 739 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 HTRA3P83110 453 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 APLP1P51693 650 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPSM2P81274 684 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 CTSWP56202 376 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPC2Q8N158 579 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 HACL1Q9UJ83 578 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 E9PSI1 815 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 GCKRQ14397 625 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 C6orf229H3BNL8 230 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 H7C1W4 665 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIMBP2O15034 1052 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 EPHX2P34913 555 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 LINS1Q8NG48 757 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAF1P21675 1872 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 VPS33BQ9H267 617 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 GREM2Q9H772 168 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLFN5Q08AF3 891 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHADLQ6NUI6 762 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLLQ9UGP5 575 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAD17O75943 681 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 CXCL9Q07325 125 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 WASHC4Q2M389 1173 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 BEND3Q5T5X7 828 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 EPS15P42566 896 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCNN1DP51172 638 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 CASP7P55210 303 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 LDHDQ86WU2 507 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 MIER1Q8N108 512 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 YDJCA8MPS7 323 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 UFL1O94874 794 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 DOK7Q18PE1 504 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 EYA3Q99504 573 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM161AQ3B820 660 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 GGA1Q9UJY5 639 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITGA6P23229 1130 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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