RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 KRT24Q2M2I5 525 aa14.61□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.61□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 CAPNS2Q96L46 248 aa14.61□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.61□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 YDJCA8MPS7 323 aa14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 ECE1P42892 770 aa14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 TMC4Q7Z404 712 aa14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 MPNDQ8N594 471 aa14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 COL4A1P02462 1669 aa14.59□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 HOXB7P09629 217 aa14.59□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.59□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.59□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.59□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KIAA0556-208ENST00000568622 MAP2K2P36507 400 aa14.58□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.58□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.58□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 TAF1P21675 1872 aa14.57□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 TNIP1Q15025 636 aa14.57□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 NECTIN2Q92692 538 aa14.57□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 ABHD8Q96I13 439 aa14.57□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 RAD17O75943 681 aa14.56□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.56□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 DPF2Q92785 391 aa14.56□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 SHTN1A0MZ66 631 aa14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 RUNDC1Q96C34 613 aa14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 AOC2O75106 756 aa14.54□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF853P0CG23 659 aa14.54□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.54□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM89AQ96GI7 184 aa14.54□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CFAP44Q96MT7 982 aa14.54□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF609O15014 1411 aa14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 RTL9Q8NET4 1388 aa14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 CA12O43570 354 aa14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM161AQ3B820 660 aa14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 MICALL2Q8IY33 904 aa14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 POLLQ9UGP5 575 aa14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
KIAA0556-208ENST00000568622 PSMD14O00487 310 aa14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 EGFRP00533 1210 aa14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 NEUROD2Q15784 382 aa14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 WASHC4Q2M389 1173 aa14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 HYPKQ9NX55 129 aa14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.52□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RGS19P49795 217 aa14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 GPSM2P81274 684 aa14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 MBIPQ9NS73 344 aa14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 H7C1D1 291 aa14.5□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.5□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.5□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.5□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 NOGQ13253 232 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 GRM1Q13255 1194 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 DLK2Q6UY11 383 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 USP48Q86UV5 1035 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF428Q96B54 188 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TSKSQ9UJT2 592 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 SCN9AQ15858 1988 aa14.49□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ECE2O60344 883 aa14.48□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZIC5Q96T25 663 aa14.48□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 EYA3Q99504 573 aa14.48□□□□□ -0.09
KIAA0556-208ENST00000568622 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms