RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF609O15014 1411 aa25.61■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RUFY3Q7L099 469 aa25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC27A2O14975 620 aa25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHLPP1O60346 1717 aa25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NRAPQ86VF7 1730 aa25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARXQ96QS3 562 aa25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PALLDQ8WX93 1383 aa25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAF5LO75529 589 aa25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSF1RP07333 972 aa25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRE11P49959 708 aa25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC24Q50LG9 513 aa25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT32Q14532 448 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDB1Q16531 1140 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD1Q15327 319 aa25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLRP10Q86W26 655 aa25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPEF2Q9C093 1822 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1B0GUL7 405 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAMTS2O95450 1211 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TIMM10P62072 90 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM89AQ96GI7 184 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPA1P15085 419 aa25.53■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.53■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HLFQ16534 295 aa25.52■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLIM4O00461 696 aa25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPS6KB1P23443 525 aa25.5■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPTP24298 496 aa25.5■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.5■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GORABQ5T7V8 394 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MBD3O95983 291 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTSWP56202 376 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABCC12Q96J65 1359 aa25.48■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.48■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BARGINQ6ZT62 677 aa25.48■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.47■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.47■■□□□ 1.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms