RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	KAZALD1	Q96I82	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	SUCLG2	Q96I99	432 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	SPEF2	Q9C093	1822 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573		H7C1W4	665 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	MEIS3	Q99687	375 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	USP44	Q9H0E7	712 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF181	Q9P0P0	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	GRM8	O00222	908 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	STYK1	Q6J9G0	422 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CNKSR1	Q969H4	720 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CTSW	P56202	376 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	FOXO4	P98177	505 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CHD4	Q14839	1912 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	GRIN3B	O60391	1043 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	PDE8A	O60658	829 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	SBF1	O95248	1867 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	RIMBP2	O15034	1052 aa		12.77	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	COL4A5	P29400	1685 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ITGA6	P23229	1130 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	PTPRC	P08575	1304 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	RGL2	O15211	777 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TAF5L	O75529	589 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ALDH1B1	P30837	517 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	GPSM2	P81274	684 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	GRAP	Q13588	217 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	AOC3	Q16853	763 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	MYH3	P11055	1940 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	KLRK1	P26718	216 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	POLL	Q9UGP5	575 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SIL1	Q9H173	461 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	DOK7	Q18PE1	504 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC93	Q567U6	631 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRC24	Q50LG9	513 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	KIF16B	Q96L93	1317 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ALDH1L1	O75891	902 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CSF1R	P07333	972 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	JAG2	Q9Y219	1238 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SNED1	Q8TER0	1413 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		12.71	□□□□□ -0.37
FAM227B-208	ENST00000559573	LMNB1	P20700	586 aa		12.71	□□□□□ -0.37

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