RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 DLC1Q96QB1 1528 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 DCCP43146 1447 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 MYOM1P52179 1685 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 GNRH1P01148 92 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 GPC1P35052 558 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 UCN2Q96RP3 112 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TECPR2O15040 1411 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 NRAPQ86VF7 1730 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 IL2RAP01589 272 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 VSIG8P0DPA2 414 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 USP4Q13107 963 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 GLMNQ92990 594 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 SIRT1Q96EB6 747 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ERBB4Q15303 1308 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PIK3C2AO00443 1686 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TONSLQ96HA7 1378 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L5A8MUK1 530 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PPFIA3O75145 1194 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 SKIP12755 728 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 BRINP3Q76B58 766 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 IRF7Q92985 503 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 NLRP3Q96P20 1036 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PRAM1Q96QH2 718 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ORAI2Q96SN7 254 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 POGKQ9P215 609 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 SLAIN2Q9P270 581 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ATP7BP35670 1465 aa6.15□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 PXDNQ92626 1479 aa6.15□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 SLC35F4A4IF30 521 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 WIPF1O43516 503 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 SCNN1DP51172 638 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 CNKSR1Q969H4 720 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ARXQ96QS3 562 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L3A6NCW0 530 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L4A6NCW7 530 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 RHOQP17081 205 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 NCOA4Q13772 614 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 EML3Q32P44 896 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ILDR2Q71H61 639 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ITGA6P23229 1130 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC11Q96J66 1382 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 JCADQ9P266 1359 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ATP9BO43861 1147 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ADAMTS2O95450 1211 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 INHAP05111 366 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 GMPRP36959 345 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 GDF10P55107 478 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF15Q8N660 670 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms