RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TCIRG1Q13488 830 aa17.67■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GRAPQ13588 217 aa17.67■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CIAPIN1Q6FI81 312 aa17.67■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MPNDQ8N594 471 aa17.67■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CA12O43570 354 aa17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANXA1P04083 346 aa17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIPK4P57078 832 aa17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COPS6Q7L5N1 327 aa17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SH3TC1Q8TE82 1336 aa17.66■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 YDJCA8MPS7 323 aa17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RGS19P49795 217 aa17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TNIP1Q15025 636 aa17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAF1P21675 1872 aa17.65■□□□□ 0.42
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHL1O00533 1208 aa17.64■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CELF2O95319 508 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.64■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BEGAINQ9BUH8 593 aa17.64■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AOC2O75106 756 aa17.63■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HOXB7P09629 217 aa17.63■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDC37L1Q7L3B6 337 aa17.63■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DPF2Q92785 391 aa17.63■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL4A1P02462 1669 aa17.62■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RAD17O75943 681 aa17.62■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RALBP1Q15311 655 aa17.62■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ISCA1Q9BUE6 129 aa17.62■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.61■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF609O15014 1411 aa17.61■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.6■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SHTN1A0MZ66 631 aa17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC34A2O95436 690 aa17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KRT24Q2M2I5 525 aa17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM161AQ3B820 660 aa17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MICALL2Q8IY33 904 aa17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.59■□□□□ 0.41
TMC3-AS1-201ENST00000558086 H7C1D1 291 aa17.58■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RPS12P25398 132 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NOGQ13253 232 aa17.58■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GRM1Q13255 1194 aa17.58■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RTL9Q8NET4 1388 aa17.57■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PSMD14O00487 310 aa17.57■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WASHC4Q2M389 1173 aa17.57■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa17.57■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NECTIN2Q92692 538 aa17.57■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SCN9AQ15858 1988 aa17.57■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POLLQ9UGP5 575 aa17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TSKSQ9UJT2 592 aa17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PSME4Q14997 1843 aa17.56■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.55■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZIC5Q96T25 663 aa17.55■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.55■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EGFRP00533 1210 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HUNKP57058 714 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPSM2P81274 684 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SAMD7Q7Z3H4 446 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USP48Q86UV5 1035 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM89AQ96GI7 184 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DBNDD1Q9H9R9 158 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HYPKQ9NX55 129 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SAGE1Q9NXZ1 904 aa17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ECE2O60344 883 aa17.53■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KRT26Q7Z3Y9 468 aa17.53■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TBC1D16Q8TBP0 767 aa17.53■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RUNDC1Q96C34 613 aa17.53■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CFAP44Q96MT7 982 aa17.53■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EYA3Q99504 573 aa17.53■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.52■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VIL1P09327 827 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RGMBQ6NW40 437 aa17.52■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF408Q9H9D4 720 aa17.52■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa17.51■□□□□ 0.39
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms