RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558078.5

TTC23-212, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 23, humanhuman

TSL 4

Gene TTC23, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23-212ENST00000558078 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
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TTC23-212ENST00000558078 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TTC23-212ENST00000558078 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TTC23-212ENST00000558078 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TTC23-212ENST00000558078 M0R2N6 131 aa9.58□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 MAP2K3P46734 347 aa9.58□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.58□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.58□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 EML1O00423 815 aa9.57□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.56□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.56□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 ALKQ9UM73 1620 aa9.56□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.56□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 SYNMO15061 1565 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 SEC13P55735 322 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 RASSF7Q02833 373 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 DPYDQ12882 1025 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 CDCA8Q53HL2 280 aa9.55□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 DEPDC5O75140 1603 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 IQGAP1P46940 1657 aa9.55□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.54□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 CD33P20138 364 aa9.54□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC23-212ENST00000558078 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.53□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 IRS1P35568 1242 aa9.53□□□□□ -0.88
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TTC23-212ENST00000558078 RFX1P22670 979 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.52□□□□□ -0.89
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TTC23-212ENST00000558078 ZMYND15Q9H091 742 aa9.52□□□□□ -0.89
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TTC23-212ENST00000558078 GGA1Q9UJY5 639 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.52□□□□□ -0.89
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TTC23-212ENST00000558078 USP17L15C9J2P7 530 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 USP17L10C9JJH3 530 aa9.51□□□□□ -0.89
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TTC23-212ENST00000558078 USP17L12C9JPN9 530 aa9.51□□□□□ -0.89
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TTC23-212ENST00000558078 USP17L18D6R9N7 530 aa9.51□□□□□ -0.89
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TTC23-212ENST00000558078 USP17L24Q0WX57 530 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 GRIN2CQ14957 1233 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC23-212ENST00000558078 ARXQ96QS3 562 aa9.51□□□□□ -0.89
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