RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 HIP1O00291 1037 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 TAF5LO75529 589 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 FOXO4P98177 505 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 GLI3P10071 1580 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 FERMT3Q86UX7 667 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 ATP5JP18859 108 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 TIMM10P62072 90 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 DCCP43146 1447 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 SNRKQ9NRH2 765 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 CPDO75976 1380 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF609O15014 1411 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC24Q50LG9 513 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.33■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 TSPY26PQ9H489 355 aa25.33■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 H7C1W4 665 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 RPS6KB1P23443 525 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 MPNDQ8N594 471 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 A0A0G2JLW4 131 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 GOLIM4O00461 696 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 PSMA5P28066 241 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 RNF20Q5VTR2 975 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 HAUS7Q99871 368 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 CYP21A2P08686 494 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 JAK2O60674 1132 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 IL2RBP14784 551 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 UBE2HP62256 183 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM260-216ENST00000557657 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 SLAIN2Q9P270 581 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 JCADQ9P266 1359 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 PPFIA3O75145 1194 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 ABCC6O95255 1503 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 SYNE4Q8N205 404 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 NEK1Q96PY6 1258 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 EVA1CP58658 441 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 Q6ZUG5 572 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 TTC6Q86TZ1 520 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 DDX11Q96FC9 970 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 A0A1B0GUL7 405 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 FOSBP53539 338 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 FAM89AQ96GI7 184 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 EYA2O00167 538 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 BRF1Q92994 677 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 USP25Q9UHP3 1055 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM260-216ENST00000557657 PHF14O94880 888 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 ADORA1P30542 326 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 ANKRD1Q15327 319 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 CHST3Q7LGC8 479 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 TJP1Q07157 1748 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms