RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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PRRX1-208ENST00000553786 COL4A1P02462 1669 aa21.82■■□□□ 1.08
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PRRX1-208ENST00000553786 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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PRRX1-208ENST00000553786 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
PRRX1-208ENST00000553786 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRRX1-208ENST00000553786 RUNDC1Q96C34 613 aa21.82■■□□□ 1.08
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